北京306医院擅长骨科、内分泌科、口腔科、普外科、心血管内科，其中以骨科见长，是以脊柱外科为重点，结合关节外科、内镜外科和创伤外科全面发展的重点科室，是全军脊柱外科中心和总装备部骨科中心、 先后获得多项国家和军队科技进步和医疗成果奖，在军内外和国内外处于领先地位。此外，医院的内分泌科也不错，为在军内外有一定知名度和学术影响力的学科，在糖尿病足病的诊治方面达到国内先进水平。
北京306医院是三级医院，北京市首批 "基本医疗保险定点医院"。临床上，医院拥有一批技术力量雄厚的专科中心，形成了以脊柱外科为龙头，骨科、口腔科、内分泌科、心血管科、腹部外科、医学影像科等学科在国内、军内处于领先水平的重点优势学科群。此外，医院医院配备医疗设备780台件，总价值近1.2亿，有效提高了各种疾病的诊断和治疗水平。
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