上海交通大学医学院附属瑞金医院擅长烧伤整形科、内分泌科、血液内科、感染性疾病科、呼吸内科等，其中烧伤整形科最具实力，科室创造了以瑞金烧伤补液方、混核移植法、冬眠疗法等为特色的大面积烧伤治疗方法，被誉为 "中国方法"。"，成功治疗Ⅲ度烧伤面积达90%以上的患者6例（其中1例烧伤总面积达100%，Ⅲ度达94%），居世界领先水平，已成为以大面积烧伤治疗为特色的烧伤中心。
此外，上海交通大学医学院附属瑞金医院的内分泌科也不错，该专业形成于上世纪50年代，60年代成立了上海第二医科大学内分泌实验室，70年代末成立了上海市内分泌研究所。目前，该专业是教育部重点学科、国家 "211工程 "重点建设学科、卫生部内分泌代谢病重点实验室、国家药品食品监督管理局药物临床试验基地。总的来说，瑞金医院专业学科齐全，是一个不错的医院。
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